FinchTV

 FinchTVは、Sanger DNA Sequenceのデータ(scfまたはab1ファイル形式)を閲覧するためのビューワーであり、図1の表な波形として表示される。
図1 FinchTVによるab1ファイルの表示
 以下のサイトから、ダウンロード、インストールが可能である。
FinchTVの入手とインストール https://digitalworldbiology.com/FinchTV


 使用されている略号として、A(Adenine)、T(Thymine)、G(Guanine)、C(Cytosine)以外に、表1に示す略号が用いられている。

表1 ATGC以外の略号と意味
略号対応する塩基説明
R A, G puRine
Y C, T pYrimidine
M A, C aMino
W A, T Weak bond
S C, G Strong bond
K G, T Keto
B T, G, C A以外(Aの次の文字だから)
V A, G, C T以外(Tの次の文字だから)
H A, T, C G以外(Gの次の文字だから)
D A, T, G C以外(Cの次の文字だから)
N A, T, G, C aNy
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