すてーじ
スタッフ
大阪市立大学大学院医学研究科細菌学 助教
老沼 研一  (おいぬま けんいち)

プロフィール

職位 大阪市立大学大学院医学研究科細菌学 助教
所属学会 日本農芸化学会、日本生化学会、糸状菌分子生物学研究会

学歴

1997年4月 日本大学生物資源科学部応用生物科学科 入学
2001年3月 日本大学生物資源科学部応用生物科学科 卒業
2001年4月 筑波大学大学院博士課程生命環境科学研究科生物機能科学専攻 入学
2006年3月 筑波大学大学院博士課程生命環境科学研究科生物機能科学専攻 修了
2006年3月 博士 (農学)

職歴

2005年4月 日本学術振興会特別研究員 (DC2)(筑波大学生命環境科学研究科)
2006年4月 日本学術振興会特別研究員 (PD)(筑波大学生命環境科学研究科)
2007年4月 日本学術振興会海外特別研究員(University of Washington, Department of Microbiology)
2009年4月 ポストドクトラルフェロー(University of Washington, Department of Microbiology)
2011年4月 ポストドクトラルフェロー(日本大学生物資源科学部)
2012年4月 助教(筑波大学生命環境系)
2015 年4月 助教(大阪市立大学大学院医学研究科)(現職)

研究費

【科学研究費補助金】
1. 特別研究員奨励費「ニトリル代謝系の分子機能解析」
  (課題番号05J07246)、研究代表者、1,900,000円 (2005-2006年度)
2. 若手研究 (B) 「芳香族主鎖型ポリマー加水分解酵素の探索と機能解析」
  (課題番号26850060)、研究代表者、3,900,000円 (2014-2016年度)

受賞歴

1. 学長表彰(筑波大学長より、研究業績を評価され受賞) 2006年3月

研究内容

【研究テーマ】
「グラム陰性病原性細菌のクオラムセンシング機構の解析」
「結核菌/非結核性抗酸菌の薬剤耐性メカニズムの解析」

研究業績

【原著論文】
  1. Kawaguchi, H., Teramura, H., Uematsu, K., Hara, K.Y., Hasunuma, T., Hirano, K., Sazuka, T., Kitano, H., Tsuge, Y., Kahar, P., Niimi-Nakamura, S., Oinuma, K., Takaya, N., Kasuga, S., Ogino, C. and Kondo, A. “Phenyllactic acid production by simultaneous saccharification and fermentation of pretreated sorghum bagasse” Bioresource Technology, 182, 169-178 (2015).
  2. Oinuma, K., Takuwa, A., Taniyama, K., Doi, Y. and Takaya, N. “Hydrazidase, A novel amidase signature enzyme that hydrolyzes acylhydrazides” Journal of Bacteriology, 197, 1115-1124 (2015).
  3. Kawaguchi, H., Uematsu, K., Ogino, C., Teramura, H., Niimi-Nakamura, S., Tsuge, Y., Hasunuma, T., Oinuma, K., Takaya, N. and Kondo, A. “Simultaneous saccharification and fermentation of kraft pulp by recombinant Escherichia coli for phenyllactic acid production” Biochemical Engineering Journal, 88, 188-194 (2014).
  4. Nomura, J., Hashimoto, H., Ohta, T., Hashimoto, Y., Wada, K., Naruta, Y., Oinuma, K. and Kobayashi, M. “Crystal structure of aldoxime dehydratase and its catalytic mechanism involved in carbon-nitrogen triple-bond synthesis” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 110, 2810-2815 (2013).
  5. Eto, D., Watanabe, K., Saeki, H., Oinuma, K., Otani, K., Nobukuni, M., Shiratori-Takano, H., Takano, H., Beppu, T. and Ueda, K. “Divergent effects of desferrioxamine on bacterial growth and characteristics” The Journal of Antibiotics, 66, 199-203 (2013).
  6. Lintz, M.J.*, Oinuma, K.*, Wysoczynski, C.L., Greenberg, E.P. and Churchill, M.E.A. “Crystal structure of QscR, a Pseudomonas aeruginosa quorum sensing signal receptor” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 108, 15763-15768 (2011). *These authors contributed equally to this work.
  7. Sappington, K.J., Dandekar, A.A., Oinuma, K. and Greenberg, E.P. “Reversible signal binding by the Pseudomonas aeruginosa quorum-sensing signal receptor LasR” mBio, 2, e00011-11 (2011).
  8. Oinuma, K. and Greenberg, E.P. “Acyl-homoserine lactone binding to and stability of the orphan Pseudomonas aeruginosa quorum-sensing signal receptor QscR” Journal of Bacteriology, 193, 421-428 (2011).
  9. Seyedsayamdost, M.R., Chandler, J.R., Blodgett, J.A.V., Lima, P.S., Duerkop, B.A., Oinuma, K., Greenberg, E.P. and Clardy, J. “Quorum-sensing-regulated bactobolin production by Burkholderia thailandensis E264” Organic Letters, 12, 716-719 (2010).
  10. Sakashita, T., Hashimoto, Y., Oinuma, K. and Kobayashi, M. “Transcriptional regulation of the nitrile hydratase gene cluster in Pseudomonas chlororaphis B23” Journal of Bacteriology, 190, 4210-4217 (2008).
  11. Konishi, K., Ohta, T., Oinuma, K., Hashimoto, Y., Kitagawa, T. and Kobayashi, M. “Discovery of a reaction intermediate of aliphatic aldoxime dehydratase involving heme as an active center” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 103, 564-568 (2006).
  12. Hashimoto, Y., Hosaka, H., Oinuma, K., Goda, M., Higashibata, H. and Kobayashi, M. “Nitrile pathway involving acyl-CoA synthetase: Overall metabolic gene organization and purification and characterization of the enzyme” The Journal of Biological Chemistry, 280, 8660-8667 (2005).
  13. Oinuma, K., Kumita, H., Ohta, T., Konishi, K., Hashimoto, Y., Higashibata, H., Kitagawa, T., Shiro, Y. and Kobayashi, M. “Stopped-flow spectrophotometric and resonance Raman analyses of aldoxime dehydratase involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis” FEBS Letters, 579, 1394-1398 (2005).
  14. Konishi, K.*, Ishida, K.*, Oinuma, K.*, Ohta, T., Hashimoto, Y., Higashibata, H., Kitagawa, T. and Kobayashi, M. “Identification of crucial histidines involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis by aldoxime dehydratase” The Journal of Biological Chemistry, 279, 47619-47625 (2004). *These authors contributed equally to this work.
  15. Oinuma, K., Ohta, T., Konishi, K., Hashimoto, Y., Higashibata, H., Kitagawa, T. and Kobayashi, M. “Heme environment in aldoxime dehydratase involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis” FEBS Letters, 568, 44-48 (2004).
  16. Oinuma, K., Hashimoto, Y., Konishi, K., Goda, M., Noguchi, T., Higashibata, H. and Kobayashi, M. “Novel aldoxime dehydratase involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis of Pseudomonas chlororaphis B23: Sequencing, gene expression, purification, and characterization” The Journal of Biological Chemistry, 278, 29600-29608 (2003).
  17. Hashimoto, Y., Sasaki, S., Herai, S., Oinuma, K., Shimizu, S. and Kobayashi, M. “Site-directed mutagenesis for cysteine residues of cobalt-containing nitrile hydratase” Journal of Inorganic Biochemistry, 91, 70-77 (2002).
  18. Ueda, K., Oinuma, K., Ikeda, G., Hosono, K., Ohnishi, Y., Horinouchi, S. and Beppu, T. “AmfS, an extracellular peptidic morphogen in Streptomyces griseus” Journal of Bacteriology, 184, 1488-1492 (2002).
【解説等】
  1. 桝尾俊介, 老沼 研一, 高谷 直樹 「多様な微生物代謝を利用した芳香族バイオ素材の開発」  月刊 ケミカルエンジニヤリング(株式会社 化学工業社) 第58巻 第8号 38-43頁 (2013)
  2. 老沼 研一 「細菌のクオラムセンシング機構:アシルホモセリンラクトンレセプター研究の新展開」 B&I バイオサイエンスとインダストリー (一般財団法人 バイオインダストリー協会) 第71巻 第2号138-141頁 (2013)
  3. 老沼 研一 「クオラムセンシング研究の最前線 -孤立したシグナル受容体の役割を考える-」  生物工学会誌90巻6号350頁 バイオミディア欄 (2012)
サイドメニューコンテンツ

オンライン細菌学講座

ILOHA