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運動生体医学教室の前身は、大阪市立大学の保健管理センターから始まります。

1964年（昭和39年）、大阪市立大学の本学に保健診療所ができました。その初代の教授に（故）井関敏之先生が第一内科から赴任され、全学学生の健康管理の業務が開始されたことがルーツになります。

1982年（昭和57年）に2代目の教授として前田如矢先生が教養部保健体育科に赴任されました。この頃から、循環器領域を基礎としたスポーツ医学がスタートし、一般健常人や高齢者を対象にした運動医学の研究活動が開始されました。

1992年（平成4年）から本学大学院生活科学研究科の食品栄養学科、健康生理学講座を新しく開設し、博士課程と修士課程の学生指導の体制をつくり、大学院教育を開始しました。

1995年（平成７年）に藤本繁夫先生が保健体育科研究室の3代目教授に就任し、田中繁宏助教授（現武庫川女子大学教授）との2人体制で学生の健康科学の講義、生活科学部の大学院生の指導、保健管理センターでの健康管理の業務を行なってきました。

2000年（平成12年）、大学院化の流れの中で、保健体育科研究室の保健部門が医学研究科、基礎医科学専攻、都市医学大講座のなかで、運動生体医学分野として携わることになりました。同時期に藤原寛講師（現淀川キリスト教病院内科部長）の2人で研究・教育活動と大学院生指導をすすめてきました。

2006年（平成18年）に公立大学法人大阪市立大学大学院医学研究科、都市医学講座、運動生体医学分野になり、現在では吉川貴仁准教授（平成5年大阪市立大学卒）との2人体制で、1部2部の全学学生に対して全学共通教育B「現代社会と健康」講義の提供と、医学研究科の大学院生（博士課程、修士課程）の研究指導を行なっています。さらに本学（杉本町）にある保健管理センターでは、センター所長と医師として、学生の定期健康診断を行い、さらに学生・教職員を対象にした一般診療と特殊診療を介して、健康管理に関する業務を続けております。 このように保健管理センターでは、医学部の整形外科、精神科、呼吸器、循環器、消化器、代謝内分泌内科をはじめ全診療分野との連携の元で、約 9200名の本学学生、約2000名の本学教職員の健康維持管理を行なっています。