Burrows-Wheeler Aligner (BWA)

　BWAは、マッピングするためのソフトウェアパッケージである。以下の3つのアルゴリズムで構成されている。

BWA-backtrack：最大100bpのイルミナシーケンスリード用に設計されている。
BWA-SW：70bpから1Mbpの範囲のより長いシーケンス用に設計されている。
BWA-MEM：70bpから1Mbpの範囲のより長いシーケンス用に設計されている。最新のBWA-MEMは、より高速で正確であるため、一般的に高品質のクエリに推奨される。BWA-MEMは、70?100bpのリードに対してBWAバックトラックよりも優れたパフォーマンスを発揮する。

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