| 大分類 | 中分類 | 小分類 | Genus（属） ジーヌス（ゾク） |
|---|---|---|---|
| グラム陽性球菌 GPC | 連鎖状 chain | Streptococcus | |
| Enterococcus | |||
| ブドウ状 cluster | Staphylococcus | ||
| グラム陰性桿菌 GNR | 小桿菌 | Haemophilus | |
| Pasteurella | |||
| Bordetella | |||
| Brucella | |||
| Francisella | |||
| Bartonella | |||
| ブドウ糖発酵菌 | 腸内細菌科細菌 | Escherichia | |
| Klebsiella | |||
| Salmonella | |||
| Shigella | |||
| Yersinia | |||
| Serratia | |||
| Proteus | |||
| Providencia | |||
| Morganella | |||
| Citrobacter | |||
| Enterobacter | |||
| ビブリオ科 | Vibrio | ||
| エロモナス科 | Aeromonas | ||
| ブドウ糖非発酵菌 | Pseudomonas | ||
| Burkholderia | |||
| Acinetobacter | |||
| 特殊なグラム陰性桿菌 | Capnocytophaga | ||
| グラム陰性球菌 GNC | Moraxella | ||
| Neisseria | |||
| グラム陽性桿菌 GPR | 芽胞形成菌 | 嫌気性菌 | Clostridium |
| Clostridioides | |||
| Bacillus | |||
| 芽胞非形成菌 | Corynebacterium | ||
| Listeria | |||
| 嫌気性菌 | グラム陽性 | Lactobacillus | |
| Erysipelothrix | |||
| Peptococcus | |||
| Peptostreptococcus | |||
| Ruminococcus | |||
| Propionibacterium | |||
| Bifidobacterium | |||
| Eubacterium | |||
| グラム陰性 | Bacteroides | ||
| Prevotella | |||
| Porphyromonas | |||
| Fusobacterium | |||
| Leptotrichia | |||
| Streptobacillus | |||
| Veillonella | |||
| 抗酸菌 | Mycobacterium | ||
| 放線菌 | Actinomyces | ||
| Nocardia | |||
| スピリルム | Campylobacter | ||
| Helicobacter | |||
| Arcobacter | |||
| Spirillum | |||
| スピロヘータ | Treponema | ||
| Borrelia | |||
| Leptospira | |||
| Brachyspira | |||
| 非定型菌 | 細胞外増殖性 | Mycoplasma | |
| Ureaplasma | |||
| 通性細胞内増殖性 | Legionella | ||
| 偏性細胞内増殖性 | クラミジア | Chlamydophila | |
| Chlamydia | |||
| リケッチア | Rickettsia | ||
| Orientia | |||
| Coxiella | |||
| Ehrlichia | |||
| Anaplasma | |||
| Neorickettsia | |||
| 真菌 | 酵母 | 子嚢菌 | Candida |
| 担子菌 | Cryptococcus | ||
| Trichosporon | |||
| 子嚢菌 | Malasettia | ||
| 糸状菌 | 子嚢菌 | Aspergillus | |
| 接合菌 （ムーコル） | Mucor | ||
| Rhizomucor | |||
| Rhizopus | |||
| Lichtheimia(Absidia) | |||
| Cunninghamella | |||
| 子嚢菌 | Trichophyton | ||
| 培養不能 | Pneumocystis | ||
| 二形性真菌 | Coccidioides | ||
| Histoplasma | |||
| Paracoccidioides | |||
| Blastomyces | |||
| Penicillium（Talaromyces） | |||
2020年8月20日開設 2022年3月14日更新
作成にあたり、以下のサイトを参考にしています。