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大阪市立大学大学院医学研究科細菌学 講師
老沼 研一 (おいぬま けんいち) |
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プロフィール
| 職位 | 大阪市立大学大学院医学研究科細菌学 講師 |
|---|---|
| 所属学会 | 日本農芸化学会、日本生化学会、糸状菌分子生物学研究会 |
学歴
| 1997年4月 | 日本大学生物資源科学部応用生物科学科 入学 |
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| 2001年3月 |
日本大学生物資源科学部応用生物科学科 卒業
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| 2001年4月 | 筑波大学大学院博士課程生命環境科学研究科生物機能科学専攻 入学 |
| 2006年3月 | 筑波大学大学院博士課程生命環境科学研究科生物機能科学専攻 修了 |
| 2006年3月 | 博士 (農学) |
職歴
| 2005年4月 | 日本学術振興会特別研究員 (DC2)(筑波大学生命環境科学研究科) |
|---|---|
| 2006年4月 | 日本学術振興会特別研究員 (PD)(筑波大学生命環境科学研究科) |
| 2007年4月 | 日本学術振興会海外特別研究員(University of Washington, Department of Microbiology) |
| 2009年4月 | ポストドクトラルフェロー(University of Washington, Department of Microbiology) |
| 2011年4月 | ポストドクトラルフェロー(日本大学生物資源科学部) |
| 2012年4月 | 助教(筑波大学生命環境系) |
| 2015 年4月 | 助教(大阪市立大学大学院医学研究科) |
| 2021 年4月 | 講師(現職) |
研究費
【科学研究費補助金】1. 特別研究員奨励費「ニトリル代謝系の分子機能解析」
（課題番号05J07246）、研究代表者、1,900,000円 （2005-2006年度）
2. 若手研究 (B) 「芳香族主鎖型ポリマー加水分解酵素の探索と機能解析」
（課題番号26850060）、研究代表者、3,900,000円 （2014-2016年度）
受賞歴
1. 学長表彰（筑波大学長より、研究業績を評価され受賞） 2006年3月研究内容
【研究テーマ】「グラム陰性病原性細菌のクオラムセンシング機構の解析」
「結核菌/非結核性抗酸菌の薬剤耐性メカニズムの解析」
研究業績
【原著論文】- Kawaguchi, H., Teramura, H., Uematsu, K., Hara, K.Y., Hasunuma, T., Hirano, K., Sazuka, T., Kitano, H., Tsuge, Y., Kahar, P., Niimi-Nakamura, S., Oinuma, K., Takaya, N., Kasuga, S., Ogino, C. and Kondo, A. “Phenyllactic acid production by simultaneous saccharification and fermentation of pretreated sorghum bagasse” Bioresource Technology, 182, 169-178 (2015).
- Oinuma, K., Takuwa, A., Taniyama, K., Doi, Y. and Takaya, N. “Hydrazidase, A novel amidase signature enzyme that hydrolyzes acylhydrazides” Journal of Bacteriology, 197, 1115-1124 (2015).
- Kawaguchi, H., Uematsu, K., Ogino, C., Teramura, H., Niimi-Nakamura, S., Tsuge, Y., Hasunuma, T., Oinuma, K., Takaya, N. and Kondo, A. “Simultaneous saccharification and fermentation of kraft pulp by recombinant Escherichia coli for phenyllactic acid production” Biochemical Engineering Journal, 88, 188-194 (2014).
- Nomura, J., Hashimoto, H., Ohta, T., Hashimoto, Y., Wada, K., Naruta, Y., Oinuma, K. and Kobayashi, M. “Crystal structure of aldoxime dehydratase and its catalytic mechanism involved in carbon-nitrogen triple-bond synthesis” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 110, 2810-2815 (2013).
- Eto, D., Watanabe, K., Saeki, H., Oinuma, K., Otani, K., Nobukuni, M., Shiratori-Takano, H., Takano, H., Beppu, T. and Ueda, K. “Divergent effects of desferrioxamine on bacterial growth and characteristics” The Journal of Antibiotics, 66, 199-203 (2013).
- Lintz, M.J.*, Oinuma, K.*, Wysoczynski, C.L., Greenberg, E.P. and Churchill, M.E.A. “Crystal structure of QscR, a Pseudomonas aeruginosa quorum sensing signal receptor” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 108, 15763-15768 (2011). *These authors contributed equally to this work.
- Sappington, K.J., Dandekar, A.A., Oinuma, K. and Greenberg, E.P. “Reversible signal binding by the Pseudomonas aeruginosa quorum-sensing signal receptor LasR” mBio, 2, e00011-11 (2011).
- Oinuma, K. and Greenberg, E.P. “Acyl-homoserine lactone binding to and stability of the orphan Pseudomonas aeruginosa quorum-sensing signal receptor QscR” Journal of Bacteriology, 193, 421-428 (2011).
- Seyedsayamdost, M.R., Chandler, J.R., Blodgett, J.A.V., Lima, P.S., Duerkop, B.A., Oinuma, K., Greenberg, E.P. and Clardy, J. “Quorum-sensing-regulated bactobolin production by Burkholderia thailandensis E264” Organic Letters, 12, 716-719 (2010).
- Sakashita, T., Hashimoto, Y., Oinuma, K. and Kobayashi, M. “Transcriptional regulation of the nitrile hydratase gene cluster in Pseudomonas chlororaphis B23” Journal of Bacteriology, 190, 4210-4217 (2008).
- Konishi, K., Ohta, T., Oinuma, K., Hashimoto, Y., Kitagawa, T. and Kobayashi, M. “Discovery of a reaction intermediate of aliphatic aldoxime dehydratase involving heme as an active center” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 103, 564-568 (2006).
- Hashimoto, Y., Hosaka, H., Oinuma, K., Goda, M., Higashibata, H. and Kobayashi, M. “Nitrile pathway involving acyl-CoA synthetase: Overall metabolic gene organization and purification and characterization of the enzyme” The Journal of Biological Chemistry, 280, 8660-8667 (2005).
- Oinuma, K., Kumita, H., Ohta, T., Konishi, K., Hashimoto, Y., Higashibata, H., Kitagawa, T., Shiro, Y. and Kobayashi, M. “Stopped-flow spectrophotometric and resonance Raman analyses of aldoxime dehydratase involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis” FEBS Letters, 579, 1394-1398 (2005).
- Konishi, K.*, Ishida, K.*, Oinuma, K.*, Ohta, T., Hashimoto, Y., Higashibata, H., Kitagawa, T. and Kobayashi, M. “Identification of crucial histidines involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis by aldoxime dehydratase” The Journal of Biological Chemistry, 279, 47619-47625 (2004). *These authors contributed equally to this work.
- Oinuma, K., Ohta, T., Konishi, K., Hashimoto, Y., Higashibata, H., Kitagawa, T. and Kobayashi, M. “Heme environment in aldoxime dehydratase involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis” FEBS Letters, 568, 44-48 (2004).
- Oinuma, K., Hashimoto, Y., Konishi, K., Goda, M., Noguchi, T., Higashibata, H. and Kobayashi, M. “Novel aldoxime dehydratase involved in carbon-nitrogen triple bond synthesis of Pseudomonas chlororaphis B23: Sequencing, gene expression, purification, and characterization” The Journal of Biological Chemistry, 278, 29600-29608 (2003).
- Hashimoto, Y., Sasaki, S., Herai, S., Oinuma, K., Shimizu, S. and Kobayashi, M. “Site-directed mutagenesis for cysteine residues of cobalt-containing nitrile hydratase” Journal of Inorganic Biochemistry, 91, 70-77 (2002).
- Ueda, K., Oinuma, K., Ikeda, G., Hosono, K., Ohnishi, Y., Horinouchi, S. and Beppu, T. “AmfS, an extracellular peptidic morphogen in Streptomyces griseus” Journal of Bacteriology, 184, 1488-1492 (2002).
- 桝尾俊介, 老沼 研一, 高谷 直樹 「多様な微生物代謝を利用した芳香族バイオ素材の開発」 月刊 ケミカルエンジニヤリング（株式会社 化学工業社） 第58巻 第8号 38-43頁 (2013)
- 老沼 研一 「細菌のクオラムセンシング機構：アシルホモセリンラクトンレセプター研究の新展開」 B＆I バイオサイエンスとインダストリー （一般財団法人 バイオインダストリー協会） 第71巻 第2号138-141頁 (2013)
- 老沼 研一 「クオラムセンシング研究の最前線 -孤立したシグナル受容体の役割を考える-」 生物工学会誌90巻6号350頁 バイオミディア欄 (2012)
